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Bioinfomatics

석사 졸업 논문(from Juhwan)

xyz1 2022. 4. 16. 10:30

졸업논문.pdf
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#Abstract (국문)
암세포는 특정 세포에서 수많은 변이가 발생한다. 이러한 변이는 환경 요인 및 세포 분열 중 오류와 같은 많은 요인에 의해 발생한다. 하지만 발생한 모든 변이들이 종양 발 달에 영향을 미치는 것은 아니다. 다시말하자면, 일부 변이는 암 발생에 영향을 미치고 일부는 그렇지 않다는 것이다. 따라서, 암 발생에 영향을 미치는 변이를 선별하는것이 굉장히 중요하다. 하지만, 종양 발달에 영향을 미치는 변이의 개수가 굉장히 많기 때문에 이로 인해 영향을 미치는 변이를 구분하기가 어려워진다. 이전의 연구의 접근법은 대규모 샘플에서 재발 유전자를 찾았었다. 재발 유전자가 나타날 확률이 낮기 때문에 이러한 접근법을 통해서 종양 발달에 영향을 미치는 유의미한 유전자를 찾을 수 있었다. 하지만 기존의 접근 방식은 대규모 코호트에만 적용될 수 있으며 종양 이질성 등으로 인해 개별 샘플을 분석하는데에는 한계가 존재한다. 따라서, 개별 암환자의 정확한 분석을 하기 위해서는 새로운 접근 방식이 필요하다. 본 연구에서는 전장 게놈 서열 과 전사체 서열 데이터를 이용하여 각 샘플별로의 드라이버 유전자를 식별하는 파이프 라인을 구축했다. 또한, 우리는 이러한 후보 드라이버 유전자가 약물 타겟이 될 수 있는지도 확인했다. 결론적으로, 이 파이프 라인을 사용함으로써 각 종양 샘플의 드라이버 유전자와 약물 타겟 유전자를 동시에 얻을 수 있었다. 우리의 연구에 따르면 변이 유전자의 약 5 %가 종양에서 드라이버 유전자와 약물 표적 유전자로 밝혀졌다.


#느낀점
지금 돌이켜보니 대학원 빨리 탈출하고 싶어서 대충 쓴 느낌이 굉장히 강하다.... 왜 그랬을까 반성중이다.


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